Pues por los sintomas que ne cuentas solo veo como posible una candiasis pero tu mismo dices que te hicieron la prueba y salio negativo. Gonorrea o Sifilis habrían salido en ese exudado que te hicieron que dio bacterias comunes. La otra posibilidad es que las manchas sean manchas cutáneas normales. Lo de la diarrea puede deberse perfectamente a causa ajenas a tu relación sexual relacionadas con alimentación u otras causas ambientales que ambos compartís.
Has nombrado una crema aparte del antibiótico. ¿Que crema es? Porque sospecho que es un fungicida.